I klassisk Škoda stil byder bagagerummet i Fabia også på en række meget praktiske features. Genstande kan fastgøres i bagagerummet ved hjælp af bagageholdere. Du skal blot sætte dine kasser og indkøbsposer, eksempelvis, ind mellem siden af bagagerummet og holderen, og så rutsjer de ikke længere rundt. Bagageholderen kan klappes væk og opbevares under bagagerumsbunden.